立山国际高中的白羽由希奈，国产观在三人面谈后追赶暴风雨般离开的母亲·洋海为了送还遗忘的智能手机，国产观朋友荻布美夏也一起到母亲的工作场所黑部研究所去。在大厅里顺利的把智能手机交给了母亲，相识的研究人员、荒俣稔等人说着的话的时候突然火球飞来了，产生的冲击波将研究所的窗户玻璃震碎了。在警报鸣响的研究所地基内，身份不明的侵略者同警备员们展开战斗，打算到地下避难的由希奈的目光停留在了实验室里方块发出的奇怪的光上。立山黑部峡谷在修筑大坝时发现神秘的遗迹。为研究“Artifact”设立了国际联合黑部研究所。世界各国的首脑聚集在研究所员的孩子就读的立山国际高中。研究所长的女儿、白羽由希奈也在这里上学。那是2016年的夏天、一名武士再一次苏醒。
回复 :小智（松本莉香 配音）来自真新镇，他的目标是要成为神奇宝贝顶级训练师。在即将展开训练师旅程的一天，因为迟到，他并没有拿到初始的小精灵。大木博士（石冢运昇 配音）见状，便送了一只不愿进精灵球和非常调皮的皮卡丘给这位失落的年轻人。于是，他们俩便踏上了精灵宝可梦的旅程。在旅途中，他们的之间的隔阂逐渐打破，并认识了同行的伙伴诚子（佐藤刊里 配音）与宗次（本乡奏多 配音），并听到了有关凤王的传说。“受到虹色之羽的引导，见到凤王的人，就会成为彩虹勇士...”本部剧场版是《神奇宝贝》动画系列的第二十部电影。该部电影的剧情是系列动画第一集《神奇宝贝！就决定是你了！》的改编，描述小智与皮卡丘踏上成为宝可梦大师的冒险之旅。
回复 :隶属于BASS的佣兵克里斯（凯文·道尔曼 Kevin Dorman 配音）奉命前往某处洋馆调查武器走私案件，哪知道在那里遇见了国际通缉犯格伦（约翰·德米塔 John DeMita 配音），两人交手数回合之后，格伦夺路而逃。大学教授瑞贝卡（艾琳·卡希尔 Erin Cahill 配音）正在研究死者复活伤人时间，由此发现了新型病毒的存在，并且迅速研制出了针对这种病毒的解药，哪知道在这个节骨眼上，研究所遭到恐怖分子的袭击，好在关键时刻克里斯赶到了，救出了瑞贝卡。之后，两人同美国总统直属部队DSO的成员里昂（马修·默瑟 Matthew Mercer 配音）汇合，三人发现，格伦真正的目标正是新型病毒，他想要制造一场破坏性极强的生化危机。
回复 :地球即将被毁灭，妮姆芙、阿斯特雷亚纷纷死去……为了拯救世界，仅剩的伊卡洛斯带着樱井智树飞往天空之城--西纳普斯。美丽的空中，伊卡洛斯回想起过去的日子……和主人在一起的时光，每一天、每一分、每一秒，都很幸福……燃烧的伊卡洛斯，和樱井智树，最终的命运是……？
