故事发生在东京八丈岛近海，日韩一座将全球各地警方监控相连接的高科技设施——“太平洋浮标”即将启动。为了与欧洲刑警组织管辖的范围联网，日韩来自世界各地的工程师聚集在这里。基于人脸识别的全新“黑科技”也正在测试中……与此同时，柯南一行人前往八丈岛观鲸，途中柯南接到冲矢昴（赤井秀一）的电话，被告知欧洲刑警组织成员在德国遭到琴酒的杀害。为调查真相的柯南潜入“太平洋浮标”。正当工程师们正在为系统启动而展开准备工作时，一桩案件突然发生！一名女工程师被黑暗组织绑架，她手中存有核心技术的U盘也落入了黑暗组织手中！此时，水下传来未知潜水艇逼近的声音，令人毛骨悚然，一个神秘的黑影也正在悄悄接近灰原哀……
回复 :东京、大阪、京都相继发生杀人事件，5名死者皆是被头戴面具的黑影人用武士刀和弓箭瞬间杀害。警方介入调查，发现死者都是出没于3地专门偷窃有名的佛像及美术品的偷盗集团“源氏萤”成员。该集团共有成员8名，以义经的家臣名字互相称呼，且都持有一本《义经记》，被害5人手中的《义经记》均被拿走。这日京都古寺山能寺收到奇怪书信，说若能解开信中所附的画谜，便能找到8年前被窃的如来佛像。柯南、小兰随毛利小五郎来到该寺，均对画谜一筹莫展。5名被杀者之一曾对与新一不相上下的大阪高中生服部平次照料有加，服部也来到京都对案件秘密展开调查，并借机找寻自己的初恋情人。柯南与服部相遇联手调查时，发现有人想置服部于死地，紧接“源氏萤”另一成员被害，而这一切，似乎又都与画谜有关。
回复 :根岸崇一（岸尾大辅 配音）是一个老实巴交的青年，怀揣着对于未来的希冀，他只身一人来到东京念大学。崇一非常的热爱音乐，尤其是流行乐，他最大的梦想就是可以抱着吉他，将自己喜欢的歌唱给更多的人听。为了出人头地，崇一参加了新人音乐家招募的活动，哪知道在误打误撞之中加入了名叫“Detroit Metal City”的恶魔系重金属乐队，成为了其中的骨干。崇一在脸上涂抹古怪的油彩，违心的以嘶吼的方式唱着狂野劲爆的歌，哪知道他的表演竟然意外的大受好评，很快，崇一就在重金属摇滚圈里出了名。崇一暗恋着名为相川由利（长泽雅美 配音）女孩，糟糕的是，相川最讨厌的就是重金属了，为了成就自己小小的恋情，崇一处心积虑的想要隐瞒自己大大的秘密。
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