新的学年开始了，数码洛克和他的伙伴们努力学习，数码向最高难度的徽章发起挑战。然而，当洛克王国洛克和朋友们初次踏入幽暗空间时，却得知学院遭遇了空前的危机，播出由于时光扭曲，他们回到一个月之后的学院，此时学院已经完全沦陷，所有学生和老师都被恩佐控制。洛克和伙伴们想尽办法回到了原有的时空，找出的圣光羽石，粉碎了恩佐的阴谋，学院的危机被悄悄解除。