柯南和小五郎等拉着大队，春暖来到位于太平洋中的美丽小岛“神海岛”渡假。这座岛屿自古已有流传，春暖大概有关沉没于海底的古代遗迹“海底宫殿”，及300年前两名女海盗遗留下来的宝藏传说。小兰和园子不惧流传，在“海底宫殿”附近潜水时，意外遇到一大群正在寻找宝物的猎人，不料其中一人突然遭鲨鱼攻击，不幸身亡！小兰和园子幸运逃难，柯南见那位猎人死状诡异，与灰原一起展开调查。柯南认为猎人之死，跟宝藏传说有着莫大关系，他试图解开背后原因，“海底宫殿”的谜题一直系绕在他的脑海中。他找到了一组神秘名词“Jolly Roger(海盗旗)”后，满以为有所起色，猎人却突然现身，并偷走了原来发现的宝藏！小兰和园子落在猎人的魔掌之中，性命危在旦夕！隐藏于传说中的讯息是什么？“海底宫殿”有什么秘密？穿越300年时光的暗号，柯南誓要逐步解开迷题
回复 :城市里连续发生着不可思议的奇怪事件，还有为解决事件聚集起来的拥有特殊力量的少女：修道院里的十四岁孤儿----叶山小十乃、身为偶像的----白藤菜月以及与前世的噩梦战斗的谜之少女----圣三咲。想要审判污秽现有世界的人，想要保护现有世界的人，谁代表正义？谁又代表邪恶？失去记忆的少年出现了，命运的齿轮分明已经开始转动，新生？毁灭？还是……不可知的未来？
回复 :战火纷飞的外星异世界，一艘太空船摆脱追兵高速离去。此刻在银河遥远的另一端，地球上的天才少年发明家阿纯正和一班朋友们过着无忧无虑的校园生活。晚上阿纯回到家时，家里自制的飞碟探测器突然警报大作。阿纯激动地邀约死党凌子前往郊外寻找坠落的飞碟，在一个燃烧着火焰的大坑旁边，阿纯找到了有生以来最大的发现——装有外星人的逃生舱……
回复 :三巫组占领了黑云塔学院，并利用蕾儿的女巫朋友瑟莱拉把传奇之书-传奇收藏的妖魔释放出来为害人间。仙灵组这次要暂时共同使用神龙圣火来变身成仙灵魔法，可是蕾儿在行动中不小心伤害了芙罗菈而自责离队，她们还可以发挥新的力量－幻形仙法吗？
